Hakodate Motomachi Hotel est situé dans le quartier historique de Motomachi à Hakodate, connu pour son charmant architecture de style occidental et ses vues pittoresques sur la baie. L'hôtel est proche de sites notables tels que le mont Hakodate, à environ 1.1 km, l'église de Motomachi, et le musée d'art de Hakodate à moins de 2 km. L'aéroport de Hakodate est situé à environ 9 km de l'hôtel.