Yamadaya Hotel si trova nella tranquilla area di Shoji a Fujikawaguchiko, nota per il suo sereno ambiente lacustre all'interno del Parco Nazionale Fuji-Hakone-Izu. L'hotel dista solo 0,4 km dal Lago Shōji e circa 3.6 km dal Lago Motosu, entrambi offrono viste mozzafiato sul Monte Fuji. Il vivace centro città di Fujikawaguchiko si trova a circa 20 km di distanza. L'aeroporto principale più vicino è l'Aeroporto di Mt. Fuji Shizuoka, situato a circa 80 km dall'hotel.