Toyota Shirakawa-go Eco-Institute está localizado na pacífica vila de Shirakawamura, na Prefeitura de Gifu, conhecida por suas tradicionais casas com telhados de palha e sua paisagem rural cênica. O hotel fica a cerca de 3 km do Terminal de Ônibus Shirakawa-go e perto da Estrada Branca Hakusan Shirakawa-go, uma rota cênica popular. A Vila Histórica de Shirakawa-go, um Patrimônio Mundial da UNESCO, está a 5 km. O aeroporto principal mais próximo é o Aeroporto de Komatsu, aproximadamente 70 km do hotel.