Mibu-Juku befindet sich im ruhigen Stadtteil Shimogyo in Kyoto, der für seinen traditionellen Charme und die bequeme Anbindung an das Stadtzentrum bekannt ist. Das Hotel ist zu Fuß erreichbar vom Kyoto Railway Museum und dem Kyoto Aquarium, beide etwa 0,3 km entfernt. Der historische Mibu-Tempel, der mit den Shinsengumi verbunden ist, befindet sich ebenfalls in der Nähe. Der internationale Flughafen Osaka ist ungefähr 36 km vom Hotel entfernt.