Unzen Fukudaya está situado en la histórica ciudad termal de Unzen, en la Prefectura de Nagasaki, conocida por sus onsens terapéuticos y paisajes volcánicos escénicos. El hotel se encuentra a 5 minutos a pie de Unzen Jigoku Hell, una famosa área de aguas termales volcánicas, y a unos 5 minutos en coche de la estación del teleférico de Unzen, que ofrece vistas panorámicas de la región. El Castillo de Shimabara, un notable sitio cultural, está aproximadamente a 30 km de distancia. El Aeropuerto de Nagasaki se encuentra a unos 60 km del hotel.